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17 January 2024 The need for proper archiving and referencing of sound recordings in taxonomic studies of birds
Rafael Dantas Lima
Author Affiliations +
Abstract

A survey of recent taxonomic studies of birds that included acoustic trait analyses reveals that most studies have not archived the sound recordings that support their conclusions, despite the current availability of online, publicly available collections of bird sounds. In addition, bird sound recordings have often been cited without unique accession numbers that permit unambiguous sample identification and in considerably less detail than other types of samples, such as museum specimens or genetic samples. Both this lack of data openness and the way acoustic samples have been cited undermine the methodological rigor that otherwise characterizes many of these studies, and much invaluable biological data are likely to be lost over time if bird sound recordings are not archived in long-term collections. I suggest that these problems can be easily addressed by embracing the open data movement and adopting some best practices that are widely used in other fields. Just as study skins and DNA sequences are required to be deposited in publicly available collections such as natural history museums and the GenBank, respectively, sound recordings used in taxonomic studies with acoustic trait analyses should be archived in publicly available collections as a condition for publication of associated results. Authors of taxonomic studies involving sounds should archive their sound recordings and provide unique accession numbers for sound recordings examined, and journals and reviewers should ensure that authors have done so. By embracing the open data movement, research studying avian acoustic signals is expected to become more transparent, reproducible, and useful.

LAY SUMMARY

  • While some studies of acoustic trait variation of birds have archived the recordings that support their conclusions, many have not.

  • Despite being invaluable behavioral specimens that document part of an individual's phenotype, bird sound recordings have not been treated with the same practices in data archiving as other types of specimens.

  • Proper archiving of bird sound recordings is worthwhile to promote research on avian acoustic signals that is transparent and reproducible, and to ensure that invaluable biological data are not lost over time.

  • Authors of taxonomic studies involving sounds should archive their sound recordings in long-term, publicly available collections and provide unique accession numbers for sound recordings.

  • Journals should require authors of taxonomic studies involving sounds to archive their recordings as a condition for publication and to provide unique accession numbers, and reviewers should confirm that authors have done so.

  • Researchers studying avian acoustic signals should embrace the open data movement to enhance the transparency, reproducibility, and utility of acoustic trait studies.

Una revisión de los recientes estudios taxonómicos de aves que incluyeron análisis de rasgos acústicos revela que la mayoría de los estudios no han archivado las grabaciones de sonido que respaldan sus conclusiones, a pesar de la disponibilidad actual de colecciones en línea, públicamente accesibles, de sonidos de aves. Además, las grabaciones de sonido de aves a menudo se han citado sin números de acceso únicos que permitan una identificación de muestra inequívoca y con mucho menos detalle que otros tipos de muestras, como especímenes de museo o muestras genéticas. Tanto la falta de apertura de los datos como la forma en que se han citado las muestras acústicas socavan el rigor metodológico que caracteriza de otra manera a muchos de estos estudios, y es probable que se pierdan datos biológicos invaluables con el tiempo si las grabaciones de sonido de aves no se archivan en colecciones a largo plazo. Sugiero que estos problemas pueden abordarse fácilmente adscribiendo al movimiento de datos abiertos y siguiendo algunas de las buenas prácticas ampliamente utilizadas en otros campos. Así como se requiere que las pieles de estudio y las secuencias de ADN se depositen en colecciones públicamente disponibles como museos de historia natural y el GenBank, respectivamente, las grabaciones de sonido utilizadas en estudios taxonómicos con análisis de rasgos acústicos deben archivarse en colecciones públicamente disponibles como condición para la publicación de los resultados asociados. Los autores de estudios taxonómicos que involucran sonidos deben archivar sus grabaciones de sonido y proporcionar números de acceso únicos para las grabaciones de sonido examinadas, y las revistas y revisores deben asegurarse de que los autores lo hayan hecho. Así, se espera que la adscripción al movimiento de datos abiertos posibilite que la investigación sobre las señales acústicas de las aves sea más transparente, reproducible y útil.

Rafael Dantas Lima "The need for proper archiving and referencing of sound recordings in taxonomic studies of birds," Ornithology 141(2), 1-5, (17 January 2024). https://doi.org/10.1093/ornithology/ukae004
Published: 17 January 2024
KEYWORDS
acoustic signals
archivo de datos
behavioral specimens
bird song
canto de aves
data archiving
datos abiertos
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