Infectious bronchitis is an acute and highly contagious disease in chickens caused by the infectious bronchitis virus (IBV), which has caused significant economic losses to the poultry industry worldwide. The antigenic variant, the QX-like genotype (GI-19 lineage), has been currently reported in epidemics in East Asia, Southeast Asia, the Middle East, Europe, and Africa. We first reported an epidemic of Japanese QX-like IBVs genetically related to Chinese and South Korean strains in the Kyushu region of Japan in 2020. However, because their nationwide prevalence was unknown, we performed a nationwide survey. The testing of 419 reverse transcription (RT)-PCR–positive samples (376 layers and 43 broilers) of IBV field strains between April 2016 and March 2022 detected two QX-like IBVs in 2019 and 2021 broiler samples from one region. A survey of fecal samples collected from 122-layer farms nationwide between November 2022 and January 2023 detected QX-like IBV genes from seven farms in various regions. Phylogenetic tree analysis on the basis of the S1 gene showed that all QX-like IBVs detected in Japan were genetically related to recent Chinese and South Korean strains. A new RT-PCR assay was developed to distinguish between QX-like IBV and other IBV variants prevalent in Japan, whose results were consistent with those of previously reported identification methods. These results suggest that QX-like IBV is rapidly spreading in Japan and that countermeasures are necessary.
Estudio de la prevalencia molecular del virus de la bronquitis infecciosa similar a la cepa QX en Japón entre los años 2016 al 2023.
La bronquitis infecciosa es una enfermedad aguda y altamente contagiosa del pollo causada por el virus de la bronquitis infecciosa (IBV), que ha causado importantes pérdidas económicas a la industria avícola en todo el mundo. Actualmente se ha reportado la variante antigénica, el genotipo similar a la cepa QX (cepa GI-19), en brotes en el este de Asia, el sudeste de Asia, el Medio Oriente, Europa y África. Primeramente, se reportó un brote con virus japoneses similares a QX que eran genéticamente relacionados con cepas chinas y surcoreanas en la región de Kyushu en Japón en el 2020. Sin embargo, debido a que se desconocía su prevalencia a nivel nacional, se realizó una encuesta a nivel nacional. Mediante el análisis de 419 muestras positivas a la presencia de cepas de campo por transcripción reversa (RT) y PCR (376 de ponedoras y 43 de pollos de engorde) entre abril del 2016 y marzo del 2022 se detectaron dos virus de bronquitis infecciosa similares a la cepa QX en el 2019 y en el 2021 en muestras de pollos de engorde de una región. Una encuesta de muestras fecales recolectadas de granjas de 122 ponedoras en todo el país entre noviembre del 2022 y enero del 2023 detectó genes de bronquitis infecciosa similares a la cepa QX de siete granjas en varias regiones. El análisis del árbol filogenético basado en el gene S1 mostró que todos los virus similares a la cepa QX detectados en Japón estaban relacionados genéticamente con cepas recientes de China y Corea del Sur. Se desarrolló un nuevo ensayo de RT-PCR para distinguir entre los virus de bronquitis infecciosa similares a la cepa QX y otras variantes del IBV prevalentes en Japón, cuyos resultados fueron consistentes con los de los métodos de identificación reportados anteriormente. Estos resultados sugieren que virus de bronquitis infecciosa similares a la cepa QX se están extendiendo rápidamente en Japón y que se necesitan medidas de control.
